Το ΕΤΤ ήταν ο βασικός παιδαγωγικός συνεργάτης στην ανάπτυξη του λογισμικού 'Αβάκιο' από την Ε.Μ. 3 του Ι.Τ.Υ. (1993-2002), που αποτελεί πλατφόρμα δευτερογενούς ανάπτυξης διερευνητικού λογισμικού για την εκπαίδευση. Το εργαστήρι αποτελεί κοιτίδα εξειδίκευσης στη δευτερογενή ανάπτυξη διερευνητικού λογισμικού ποικιλίας και διαθεματικού συνδυασμού αντικειμένων, όπως τα μαθηματικά, η φυσική, η γεωγραφία, η ιστορία, η γλώσσα και η πληροφορική. Στα πλαίσια αυτής της αλληλεπίδρασης προέκυψαν και τα τρία web-based συγγραφικά εργαλεία του εργαστηρίου, ο σχεδιασμός του περιβάλλοντος των οποίων βασίζεται σε παλαιότερα λογισμικά του Αβάκιου.